Home ПОПОВ Владимир Олегович
член-корреспондент РАН, доктор химических наук


заведующий лабораторией инженерной энзимологии




Контактные адреса:
119071 Москва, Ленинский проспект, д. 33, стр.2, Институт биохимии им. А.Н.Баха РАН
тел.: (495)-952-3441
факс: (495)-952-3441
e-mail:
vpopov ЭТ inbi.ras.ru


Образование и ученые степени:
   
МГУ им.М.В.Ломоносова, Химический факультет.
МГУ им.М.В.Ломоносова, Химический факультет.
Институт биохимии им.А.Н.Баха РАН.
Институт биохимии им.А.Н.Баха РАН.
член-корреспондент РАН
 
Место работы:
   
2001-н/в Директор Института биохимии им.А.Н.Баха РАН.
1999-2001 Зам.директора по науке Института биохимии им.А.Н.Баха РАН.
1991-н/вЗаведующий лабораторией инженерной энзимологии Института биохимии им.А.Н.Баха РАН.
1987-1991 Ведущий научный сотрудник, руководитель группы структурно-функциональных исследований макромолекул Института биохимии им.А.Н.Баха РАН.
1981-1987 Старший научный сотрудник Института биохимии им.А.Н.Баха РАН.
1977-1981 Младший научный сотрудник кафедры химической энзимологии химического факультета МГУ им.М.В.Ломоносова.
1975-1977 Стажер-исследователь кафедры химической энзимологии химического факультета МГУ им.М.В.Ломоносова.
 
Награды и отличия:
   
1997 Премия правительства России за достижения в области науки и техники “Создание технологии биологической очистки воздуха от техногенных выбросов летучих органических соединений”
2010 Премия правительства России за достижения в области науки и техники "Создание и внедрение в отечественную практику биотехнологических методов анализа для решения социально значимых задач неонатального скрининга, контроля наркопотребления и безопасности продуктов питания"
 
Членство:
   
1991 Председатель Ученого Совета Института биохимии им.А.Н.Баха РАН
1996 Председатель Научного совета по биохимии РАН
2001 Член редколлегии журнала «Биохимия»
2002 Главный редактор журнала «Прикладная биохимия и микробиология»
2002 Заместитель Ответственного редактора ежегодника «Успехи биологической химии»
2002 Председатель научного совета по биохимии РАН
2003 Руководитель Национального контактного центра по направлению «Биотехнология, сельское хозяйство и пища» Европейской рамочной программы  FP7
2005 Представитель Российской Федерации в Рабочей группе по биотехнологии ОЭСР
2010 Руководитель отдела «Белковая Фабрика» НБИКС-Центра Национального исследовательского центра «Курчатовский институт»»
2011 Координатор российской технологической платформы «Биоиндустрия и биоресурсы»
2012 Председатель Экспертной комиссии по присуждению Премии им. А.Н. Баха
2013 Член редколлегии журнала «Российские нанотехнологии»
 
Основные научные интересы:
   
  Структурная биология. Нанобиотехнологии. Энзимология, механизм действия, структура и функция ферментов. Белковая инженерия. Инженерная энзимология. Биотрансформации. Биотехнология и охрана окружающей среды.
 
Публикации: более 250 статей в реферируемых журналах, 14 авторских свидетельств и патентов, 1 монография


     Основные работы В.О. Попова связаны с изучением структуры и механизма действия ферментов и применением биокатализаторов для решения практических задач. Им получено более 50 структур белков и белковых комплексов высокого разрешения; выяснена структура и механизм действия практически важных NAD-зависимых дегидрогеназ и металлоферментов; получен рекомбинантный ростовой фактор, контролирующий пролиферацию мышечных тканей, на основе которого создается лекарственный препарат, вошедший в стадию клинических испытаний; разработаны методики, используемые в отечественной системе нанобиобезопасности.
     Большое практическое значение имеют работы В.О. Попова в области биотехнологии и инновационной деятельности. Под его руководством реализовано несколько крупных инновационных проектов в том числе создана промышленная технология биологической очистки воздуха от техногенных выбросов летучих органических соединений; разработана комплексная технология переработки малоценного сырья животного происхождения в корма и функциональные продукты питания.
     Попов В.О. - профессор биологического факультета МГУ им. М.В. Ломоносова. Под его руководством выполнены и защищены 15 кандидатских диссертаций.

     Избранные публикации:

1. Lamzin V.S., Dauter Z., Popov V.O., Harutyunyan E.G., Wilson K.S. High resolution structures of holo and apo formate dehydrogenase.
J.Mol.Biol. (1994) v.236, 759-785.
2. Lamzin V.S., Popov V.O. NAD-dependent formate dehydrogenase.
Biochem.J. (1994) v.301, 625-643.
3. Kutzenko A.S., Lamzin V.S., Popov V.O. Conserved supersecondary structural motif in NAD-dependent dehydrogenases
FEBS Lett. (1998) v.423, N1, 105-109.
4. Popov V.O., Tishkov V.I. Protein Engineering of Formate Dehydrogenase
Biomolecular Eng. (2006) v.23, N2-3, 89–110.
5. Kravchenko I.V., Furalyov V.A. and Popov V.O. Hyperthermia and acidification stimulate mechano-growth factor synthesis in murine myoblasts and myotubes.
Biochemical and Biophysical Research Communications (2008) v.375, 271-274.
6. Polyakov K.M., Boyko K.M., Tikhonova T.V., Slutsky A., Antipov A.N., Zvyagilskaya R.A., Popov A.N., Lamzin V.S. and Popov V.O. High-resolution structural analysis of a novel octaheme cytochrome c nitrite reductase from the haloalkaliphilic bacterium Thioalkalivibrio nitratireducens
J.Mol.Biol. (2009) v.389, N5, 846-862.
7. Shabalin I.G., Filippova E.V., Polyakov K.M., Sadykhov E.G., Safonova T.N., Tikhonova T.V., Tishkov V.I. and Popov V.O. Structures of apo and holo forms of formate dehydrogenase from the bacterium Moraxella sp. C-1: towards understanding the mechanism of the closure of the interdomain cleft.
Acta Crystallographica (2009) v.D65, 1315-1325.
8. Trofimov A.A., Polyakov K.M., Boyko K.M., Tikhonova T.V., Safonova T.N., Tikhonov A.V., Popov A.N., and Popov V.O. Structures of complexes of octaheme cytochrome с nitrite reductase from Thioalkalivibrio nitratireducens with sulfite and cyanide
Acta Crystallographica (2010) Sect.D, v.66, 1043-1047.
9. Kravchenko I.V., Furalyov V.A., Lisitsina E.S., Popov V.O. Stimulation of mechano-growth factor expression by second messengers.
Arch.Biochem.Biophys. (2011) v.507, 323-331.
10. Nilov D.K., Shabalin I.G., Popov V.O., Svedas V.K. Molecular modeling of formate dehydrogenase: the formation of the Michaelis complex.
Journal of Biomolecular Structure and Dynamics (2012) Vol. 30, No. 2, 163–172.
11. Trofimov A.A., Polyakov K.M., Tikhonova T.V., Tikhonov A.V., Safonova T.N., Boyko K.M., Dorovatovskii P.V., Popov V.O. Covalent modifications of catalytic tyrosine in octaheme cytochrome c nitrite reductase and their effect on the enzyme activity.
Acta Crystallographica (2012) Sect.D, v.68, 144–153.

Публикации последних лет:

1. Bezsudnova E.Yu., Sorokin D.Yu., Tikhonova T.V. and Popov V.O. Thiocyanate hydrolase, the primary enzyme initiating thiocyanate degradation in the novel obligately chemolithoautotrophic halophilic sulfur-oxidizing bacterium Thiohalophilus thiocyanoxidans
Biochimica et Biophysica Acta - Proteins & Proteomics (2007) v.1774, N12, 1563–1570
2. Керученько Я.С., Хотченков В.П., Попов В.О., Морозкина Е.В., Марченко А.Н., Беневоленский С.В. Кассета и рекомбинантная плазмида для зкспрессии и секреции механозависимого фактора роста человека (MGF), штамм Saccharomyces cerevisiae - продуцент MGF и способ получения MGF
Патент РФ 2344173 от 27.10.06 дата выдачи 20.01.2009
3. Плетнева Н.В., Плетнев С.В., Чудаков Д.М., Тихонова Т.В., Попов В.О., Мартынов В.И., Влодавер А., Даутер З., Плетнев В.З. Пространственная структура желтого флуоресцентного белка Zyfp538 (Zoanthus sp.) при разрешении 1.8 A.
Биоорганическая химия (2007), т.33б N4, 421-430.
4. Гришутин С.Г., Синицын А.П., Савинцев И.В., Попов В.О. Способ получения кормового продукта из люпиновых семян
Патент № 2288590 от 10.12.2006
5. Zhukov V., Vepritzky A., Mitin L., Popov V. High throughput biofiltration for odour control at water purification plant. International Congress Biotechniques for Air Pollution Control, La Coruna (Spain), October 3-5 2007,
Congress proceedings P.59-66.
6. Pletneva N., Pletnev V., Tikhonova T., Pakhomov A., Popov V., Martynov V., Wlodawer A., Dauter Z., Pletnev S. Refined crystal structures of red and green fluorescent proteins from the button polyp Zoanthus.
Acta Cryst. (2007) D63, 1082-1093.
7. Разживин А.П., Степаненко И.А., Козловский В.С., Компанец В.О., Чекалин С.В., Махнева З.К., Москаленко А.А., Тихонов А.В., Попов В.О., Тихонова Т.В.. Динамика возбуждений в прочно связанных ассоциатах комплесов В800-850 и В 800-830 из фотосинтезирующей пурпурной бактерии Thirhospira sibirica.
Биолог. мембраны (2007), т.24, N6, 466-473.
8. Кравченко И.В., Фуралев В.А., Хотченков В.П., Попов В.О., Кирпичников М.П. Изучение индукции экспрессии механо-ростового фактора в системе in vitro.
ДАН (2007) т. 417, №4, с. 1-4.
9. Slutsky A., Tikhonova T., Boyko K., Polyakov K. and Popov V. From structure to function: a novel cytochrome c nitrite reductase from extremophile bacteria Thioalcalivibrion nitratireducens.
FEBS Journal (2007) v274, N1, 222 (D1-8).
10. Okunev O.N., Skomarovsky A.A., Chernoglasov V.M., Popov V.O., Zorov I.N. Method of lignocellulose materials saccahrification using enzymes produced by Penicillium funiculosum.
PCT WO 2007/114729 A1 Int.publ.date 11.10.2007, Int.filing.date 16.05.2006, prior.date 04.04.2006.
11. Kuznetsova T.V., Schulga A.A., Wulfson A.N., Keruchenko J.S., Ermolyuk Y.S., Keruchenko I.D., Tikhonov R.V., Lisitskaya K.V., Makarov A.A., Chobotova K., Khomenkov V.G., Khotchenkov V.P., Popov V.O., Kirpichnikov M.P., Shevelev A.B. Producing human mechano growth factor (MGF) in Escherichia coli.
Protein Expr Purif. (2008) v.58, N1, 70-77.
12. Тихонова Т.В., Слуцкая Э.С., Филимоненков А.А., Бойко К.М., Клейменов С.Ю., Конарев П.В., Поляков К.М., Свергун Д.И., Трофимов А.А., Хоменков В.Г., Звягильская Р.А., Попов В.О. Выделение и олигомерный состав цитохром с нитритредуктазы из галоалкалофильной бактерии Thioalkalivibrio nitratireducens.
Биохимия (2008) т.73, N2, 202-209.
13. Хоменков В.Г., Шевелев А.Б., Жуков В.Г., Загустина Н.А., Безбородов А.М., Попов В.О. Организация метаболических путей и молекулярно-генетические механизмы биодеградации ксенобиотиков у микроорганизмов.
Прикладная Биохимия и микробиология (2008) т.44, N. 2, 133–152.
14. Фуралёв В.А., Кравченко И.В., Хотченков В.П., Попов В.О. Малые интерферирующие РНК к миостатину мыши.
Биохимия (2008) т.73, N3, 420–425.
15. Kravchenko I.V., Furalyov V.A. and Popov V.O. Hyperthermia and acidification stimulate mechano-growth factor synthesis in murine myoblasts and myotubes.
Biochemical and Biophysical Research Communications (2008) v.375, 271-274.
16. Andreadeli A., Platis D., Tishkov V., Popov V., and Labrou N. Rapid Evolution of Formate Dehydrogenase Coenzyme Specificity by Site-Saturation Mutagenesis.
FEBS J. (2008) v275, N15, 3859-3869.
17. Прудскова Т.Н., Кириллович В.И., Заковряшина Н.А., Ермилина Н.И., Андреева Т.И., Бонарцева Г.А., Бонарцев А.П., Иорданский А.Л., Махина Т.К., Мышкина В.Л., Попов В.О. Способ выделения полигидроксибутирата из сухой биомассы микроорганизма.
Патент РФ на изобретение №2333962 от 17.10.2006, дата выдачи 20.09.2008.
18. Безбородов А.М., Загустина Н.А., Попов В.О. Ферментативные процессы в биотехнологии,
Наука 2008, 335 стр.
19. Крицкий М.С., Людникова Т.А., Слуцкая Э.С., Филимоненков А.А., Тихонова Т.В., Попов В.О. Фотовозбужденные флавины и птерины как инжекторы электрона в мультигемовый цитохром.
Докл.Акад.Наук (2009) т.424, N2, 1-4.
20. Керученько Я.С., Хотченков В.П., Попов В.О., Морозкина Е.В., Марченко А.Н., Беневоленский С.В. Кассета и рекомбинантная плазмида для экспрессии и секреции механозависимого фактора роста человека (MGF), штамм Saccharomyces cerevisiae – продуцент MGF и способ получения MGF.
Патент №2344173 от 20.01.09.
21. Bezsudnova E.Y., Kovalchuk M.V., Mardanov A.V., Poliakov K.M., Popov V.O., Ravin N.V., Skryabin K.G., Smagin V.A., Stekhanova T.N., Tikhonova T.V. Overexpression, purification and crystallization of a thermostable DNA ligase from the archaeon Thermococcus sp. 1519.
Acta Crystallographica (2009) v.F65, 368-371.
22. Polyakov K.M., Boyko K.M., Tikhonova T.V., Slutsky A., Antipov A.N., Zvyagilskaya R.A., Popov A.N., Lamzin V.S. and Popov V.O. High-resolution structural analysis of a novel octaheme cytochrome c nitrite reductase from the haloalkaliphilic bacterium Thioalkalivibrio nitratireducens.
J.Mol.Biol. (2009) v.389, N5, 846-862.
23. Фуралев В.А., Кравченко И.В., Попов В.О. Малые интерферирующие РНК к гену миостатина человека.
Мол.биология (2009) т.43, N4, 636-641.
24. Shabalin I.G., Filippova E.V., Polyakov K.M., Sadykhov E.G., Safonova T.N., Tikhonova T.V., Tishkov V.I. and Popov V.O. Structures of apo and holo forms of formate dehydrogenase from the bacterium Moraxella sp. C-1: towards understanding the mechanism of the closure of the interdomain cleft.
Acta Crystallographica (2009) v.D65, 1315-1325.
25. Шабалин И.Г., Поляков К.М., Тишков В.И., Попов В.О. Пространственная структура НАД+-зависимой формиатдегидрогеназы из бактерий Moraxella sp. C-1 при атомном разрешении.
Acta Naturae (2009) т.1, N3, 98-102.
26. Pletnev S., Gurskaya N., Pletneva N.V., Lukyanov K.A., Chudakov D. M., Martynov V.I., Popov V.O., Kovalchuk M.V., Wlodawer A., Daute1Z. and Pletnev V. Structural basis for phototoxicity of the genetically encoded photosensitizer killer red.
J.Biol.Chem. (2009) v.284 N46, 32028-32039.
27. Трофимов А.А., Поляков К.М., Бойко К.М., Филимоненков А.А., Дороватовский П.В., Тихонова Т.В., Попов В.О., Ковальчук М.В.. Структура комплекса восьмигемовой цитохром с нитритредуктазы из Thioalkalivibrio nitratireducens с фосфат-ионом.
Кристаллография (2010) т.55, N1, 61-67.
28. Филимоненков А.А., Звягильская Р.А., Тихонова Т.В., Попов В.О. Выделение и характеристика нитратредуктазы из галофильной серуокисляющей бактерии Thioalkalivibrio nitratireducens.
Биохимия (2010) т.75, N6, 839-847.
29. Zagustina N.A., Krikunova N.I., Kulikova A.K., Misharina T.A., Romanov M.E., Ruzhitsky A.O., Terenina M.B., Veprizky A.A., Zhukov V.G., and Popov V.O. Composition of the air emission from a tobacco factory and development of the biocatalyst for odor control.
Journal of Chemical Technology and Biotechnology (2010) v.85, N3, 320-327.
30. Stekhanova T.N., Mardanov A.V., Bezsudnova E.Y., Gumerov V.M., Ravin N.V., Skryabin K.G., Popov V.O.. Characterization of thermostable short-chain alcohol dehydrogenase from archaeon Thermococcus sibiricus.
Appl Environ Microbiol. (2010) v76, N12, 4096-4098.
31. Безсуднова Е.Ю., Гумеров В.М., Марданов А.В., Попов В.О., Равин Н.В., Скрябин К.Г. Стеханова Т.Н. Термостабильная алкогольдегидрогеназа из археи Thermococcus sibiricus.
Патент РФ 2413766 (2011).
32. Lyashenko A.V., Bezsudnova E.Y., Gumerov V.M., Lashkov A.A., Mardanov A.V., Mikhailov A.M, Popov V.O., Ravin N.V., Skryabin K.G., Stekhanova T.N, Kovalchuk M.V. Expression, purification and crystallization of a thermostable short-chain alcohol dehydrogenase from archaeon Thermococcus sibiricus.
Acta Crystallogr (2010) Sect F Struct.Biol.Cryst.Commun. v66, N6, 655-657.
33. Tikhonova T.V., Polyakov K.M., Boyko K.M., Safonova T.N., Popov V.O.. Octaheme cytochrome c nitrite reductase in
Handbook of Metalloproteins, ed A. Messerschmidt, John Wiley: Chichester. DOI: 10.1002/0470028637.met276. Published 15 September 2010.
34. Morozkina E.V., Marchenko A.N., Keruchenko J.S., Khotchenkov V.P., Popov V.O., Benevolensky S.V. Proteinase B disruption is necessary for high level production of human mechano growth factor (MGF) in Saccharomyces cerevisiae.
J.Mol.Microbiol.Biotechnol. (2010) v.18, 188-194.
35. Trofimov A.A., Polyakov K.M., Boyko K.M., Tikhonova T.V., Safonova T.N., Tikhonov A.V., Popov A.N., and Popov V.O. Structures of complexes of octaheme cytochrome с nitrite reductase from Thioalkalivibrio nitratireducens with sulfite and cyanide.
Acta Crystallographica (2010) Sect.D, v.66, 1043-1047.
36. Жуков В.Г., Загустина Н.А., Попов В.О. Средство для деструкции ацетона. Использование бактериального штамма Alcaligenes monasteriensis штамм Ас2-VH для микробиологической очистки вентиляционных выбросов от паров ацетона.
Патент РФ №2394907 2010.
37. Жуков В.Г., Загустина Н.А., Попов В.О. Средство для деструкции стирола Использование бактериального штамма Paracoccus alcaliphilus штамм Sty2-VH для микробиологической очистки вентиляционных выбросов от паров стирола.
Патент РФ №2394908 2010.
38. Kravchenko I.V., Furalyov V.A., Lisitsina E.S., Popov V.O. Stimulation of mechano-growth factor expression by second messengers
Arch.Biochem.Biophys. (2011) v.507, 323-331.
39. Нилов Д.К., Шабалин И.Г., Попов В.О., Швядас В.К. Изучение транспорта формиата через субстратный канал формиатдегидрогеназы при помощи управляемой молекулярной динамики.
Биохимия (2011) т.76, 211-213.
40. Николаев И.В., Степанова Е.В., Королева О.В., Попов В.О. Биологические активные пептидные композиции из вторичных продуктов переработки птицы.
Fleischwirtschaft International Россия (2011) т.4, N1, 61-64.
41. Kravchenko I.V., Furalyov V.A., Popov V.O. Stimulation of mechano-growth factor expression by myofibrillar proteins in murine myoblasts and myotubes.
Molecular and Cellular Biochemistry (2011) Dec 9. [Epub ahead of print] PMID:22160926.
42. Бонарцев А.П., Яковлев С.Г., Филатова Е.В., Соболева Г.М., Махина Т.К., Бонарцева Г.А., Шайтан К.В., Попов В.О., Кирпичников М.П.. Пролонгированное высвобождение противоопухолевого лекарственного вещества, паклитаксела, из микросфер на основе поли-3-оксибутирата.
Биомедицинская химия, 2011 том 57, вып. 2, с. 232-240.
43. Жуков В.Г., Веприцкий А.А., Попов В.О., Кузьменко М.Н., Подколзин А.И., Пантелеева М.В. Блок нормализации газо-воздушного потока.
Заявка № 109275. Приоритет от 10.10.2011. ООО «Инновационные биотехнологии».
44. Nilov D.K., Shabalin I.G., Popov V.O., Svedas V.K.. Molecular Modeling of Formate Dehydrogenase: the Formation of the Michaelis Complex.
Journal of Biomolecular Structure and Dynamics (2012) Submitted, positive revision.
45. Trofimov A.A., Polyakov K.M., Tikhonova T.V., Tikhonov A.V., Safonova T.N., Boyko K.M., Dorovatovskii P.V., Popov V.O. Covalent modifications of catalytic tyrosine in octaheme cytochrome c nitrite reductase and their effect on the enzyme activity.
Acta Crystallographica (2012) Sect.D, v.68, 144–153.
46. Petrova T.E., Bezsudnova E.Y., Dorokhov B.D., Slutskaya E.S., Polyakov K.M., Dorovatovskiy P.V., Ravin N.V., Skryabin K.G., Kovalchuk M.V. and Popov V.O. Expression, purification, crystallization and preliminary crystallographic analysis of a thermostable DNA ligase from the archaeon Thermococcus sibiricus.
Acta Cryst. (2012) Sect.F, v68, 163–165.
47. Горбачева М.А., Ярош А.Г., Дороватовский П.В., Ракитина Т.В., Бойко К.М., Корженевский Д.А., Липкин А.В., Попов В.О., Шумилин И.А. Новый подход к исследованию структурно-функциональных свойств белков с неизвестными функциями.
Биоорганическая химия, (2012) т.38, N1, С. 99-105.
48. Слуцкая Э.С., Безсуднова Е.Ю., Марданов А.В., Гумеров В.М., Ракитина Т.В., Попов В.О., Липкин В. М. Характеристика новой М42 аминопептидазы из кренархеи Desulfurococcus kamchatkensis.
ДАН (2012) т.42, N4, 551-554.
49. Гендриксон О.Д., Сафенкова И.В., Жердев А.В., Дзантиев Б.Б., Попов В.О.. Методы детекции и идентификации техногенных наночастиц.
Биофизика (2012).
50. Платонова Т.А., Придворова С.М., Жердев А.В., Василевская Л.С., Арианова Е.А., Гмошинский И.В., Хотимченко С.А., Дзантиев Б.Б., Попов В.О., Тутельян В.А. Идентификация наночастиц серебра в тканях слизистой оболочки тонкого кишечника, печени и селезенки крыс методом просвечивающей электронной микроскопии.
Бюллетень экспериментальной биологии и медицины (2012).



[Главная страница] - [Карта сайта] - [Поиск по сайту] 


email to INBI
Last review: 18, December, 2012.
© A.N.Bach Institute of Biochemistry of RAS, 2001-2012